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中国科学院海洋研究所机构知识库
Knowledge Management System Of Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences
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实验海洋生物学重点实... [3]
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实验海洋生物学重点实... [2]
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一种对虾肠道微生物DNA的提取方法
专利
专利类型: 发明, 专利号: CN200910263665.0, 申请日期: 2010-06-23, 公开日期: 2010-06-23
发明人:
刘淮德
;
王雷
;
刘梅
;
王宝杰
;
蒋克勇
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浏览/下载:312/1
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提交时间:2014/08/04
一种对虾肠道微生物dna的提取方法
其特征在于:1)将0.01-0.05g对虾肠道在液氮下研磨
2)将洗脱液在200g离心5-10min
并加入0.8-1.2ml?pbs、15-25μl?pvpp匀浆和200-300μl?0.5%tween-80
取上清菌液待用
沉淀中加0.8-1.2ml?pbs以200g离心取上清菌液
3)将步骤2)所得上清菌液以1200g离心5-10min
均匀后吹打洗脱3-5min
将两次离心所得上清菌液合并
收集上清菌液
合并上清液以300g离心5-10min
4)将步骤3)所得上清菌液中加100-150μlctab提取液和10-15μl溶菌酶
取上清菌液待用
放入37℃摇床
而后加15-20μl?20%(W/c)Sds和10-15μl蛋白酶k
振荡30-40min
60-70℃水浴1-2h
5)将水浴后菌液在4℃?3200g离心8-15min
取上清菌液
6)将水浴后菌液以3200g离心8-15min
而后加100-150μl?ctab液和20-25μl?20%sds混匀后
取上清菌液
7)将步骤6)所得上清菌液中加上清菌液体积0.6-0.8倍的异丙醇
涡旋
而后加入与上述上清菌液等体积的酚/氯仿混合液
而后于-20℃静置1-2h
8)将步骤7)所得沉淀中加入600-800μl?70%预冷乙醇
60-70℃水浴10-15min
14000g离心10-15min
再以4℃?14000g离心10-15min
14000g离心10-15min
取上清菌液待用
所得沉淀待用
所得沉淀即为对虾肠道微生物dna。
不同性状海带配子体的鉴定方法及可采用的部分DNA序列
专利
专利类型: 发明, 专利号: ZL200310105037.2, 申请日期: 2008-07-30, 公开日期: 2011-07-15
发明人:
段德麟
;
胡自民
;
赫英俊
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提交时间:2011/07/15
经济海藻紫菜种质资源鉴定的方法及部分DNA序列
专利
专利类型: 发明, 专利号: ZL200310105036.8, 申请日期: 2008-07-30, 公开日期: 2011-07-15
发明人:
段德麟
;
胡自民
;
赫英俊
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浏览/下载:209/0
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提交时间:2011/07/15
龙须菜选育品系和野生型及相关种鉴定的方法
专利
专利类型: 发明, 专利号: CN200410021012.9, 申请日期: 2005-07-20, 公开日期: 2005-07-20
发明人:
段德麟
;
李文红
;
胡自民
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提交时间:2014/08/04
1.龙须菜选育品系和野生型及相关种鉴定的方法
其特征在于:龙须菜的rdnaits全序列的获取
提取缓冲液的组成为:100mmoll-1tris.hcl
步骤如下:(1)总dna提取:取新鲜健康的藻体材料
Ph8.0
(2)Pcr扩增:龙须菜its区扩增的特异引物p1、p2的序列分别为:p1:5’gggatccgtttccgtaggtgaacctgc3’
用无菌水处理后
50-100mmoll-1edta
位于18s上
P2:5’gggatccatatgcttaagttcagcgggt3’
(3)Pcr产物纯化
在液氮种研磨成粉末
0.2-0.5mnacl
位于26s上
利用该引物对步骤(1)提取的dna为模板
提取总dna
5%β-巯基乙醇
对总dna进行pcr扩增反应
0.2%pvp-40
(4)Dna序列测定:纯化后的dna进行序列测定
1.0-2.5%sds
确立rdnaits区
(5)Dna序列数据分析:待分析的rdnaits区的序列一经测定
提取所用的kac浓度为4.0-5.0m
包括its1和5.8s区的全序列
用对位排列软件clustalw进行对位排列
建立用于鉴别龙须菜种内和种间差异的rapd和issr特异指纹图谱
Ph值范围在5.2-7.5
并辅以人工校对
步骤如下:1)总dna提取
2)Rapd和issr引物的合成
用系统进化分析各样品dna序列与数据库中各个序列间的差异
从大量随机引物中筛选出能稳定的扩增出特征条带的引物
3)根据扩增条带的多态性
构建龙须菜选育品系及野生型和相关种的rapd和issr特异指纹图谱。