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一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法 专利
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112325.X, 申请日期: 2012-10-10, 公开日期: 2012-10-10
发明人:  卢霞;  王鸿霞;  刘保忠
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一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法  gc含量为40％?60％  包括微卫星位点来源、引物设计、引物优化和微卫星标记家系鉴定体系  2)引物设计：在微卫星重复的侧翼序列利用软件primer?premier?5.0设计引物  退火温度为45?65℃  其特征在于：1)微卫星位点的来源：提取文蛤的基因组dna利用提取的dna  引物设计条件为：引物长度为19?25mer  预期pcr产物长度为100?400bp  采用限制性内切酶法获得文蛤基因组dna片段  并构建微卫星磁珠富集文库  检测阳性克隆  3)引物优化：根据不同引物的tm值进行温度梯度优化  经测序得到含有微卫星重复的dna序列  在tm值上下各10℃  4)微卫星标记家系鉴定体系的确立：微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(Pic)衡量  温度梯度优化扩增得到的pcr产物用8％非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳?eb染色系统进行检测  根据上述优化获得的ta值  选取杂带较少、特异性产物亮度较高的pcr反应对应的温度为该引物的最佳退火温度ta  选取多个体作为群体进行计算微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(Pic)进而衡量多态性信息  根据pic值  Pic小于0.25的标记  筛选得到重复性好、稳定性好  Pic值大于0.25的位点  作为文蛤微卫星标记家系鉴定体系  用于文蛤的家系区分与个体识别。  
鲟类线粒体基因组分子标记、遗传距离及系统演化分析 期刊论文
水产科学, 2012, 期号: 7, 页码: 413-418
作者:  申欣;  田美;  孟学平;  程汉良;  彭永兴;  李士虎
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鲟形目  线粒体基因组  选择压力  分子标记  遗传距离  系统演化  
应用新一代测序技术测定大室别藻苔虫线粒体基因组全序列 期刊论文
海洋学报(中文版), 2012, 期号: 2, 页码: 136-142
作者:  申欣;  田美;  朱长保;  刘会莲;  赵方庆
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大室别藻苔虫  线粒体基因组  新一代测序技术  巢式pcr  基因排列  
磷虾类线粒体基因组的特征和基因排列比较 期刊论文
渔业科学进展, 2012, 期号: 2, 页码: 49-55
作者:  申欣;  王海青;  王敏晓;  刘斌
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磷虾  长pcr  线粒体基因组  基因重排  分子标记  
日本鼓虾与鲜明鼓虾线粒体基因组全序列的分析比较 期刊论文
海洋学报(中文版), 2012, 期号: 5, 页码: 147-153
作者:  申欣;  李晓;  徐启华
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鼓虾  线粒体基因组  选择压力  基因排列  分子标记  
凡纳滨对虾肠道微生物宏基因组Solexa测序及其初步分析 期刊论文
海洋科学, 2012, 期号: 6, 页码: 41531
作者:  严雪平;  袁剑波;  刘斌
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肠道微生物宏基因组  Ctab  Solexa测序  
仿刺参基因组大小的测定 期刊论文
水产学报, 2012, 期号: 5, 页码: 686-695
作者:  刘进;  张晓军;  苏琳;  刘石林;  汝少国;  杨红生
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仿刺参  基因组大小  流式细胞术  
长囊水云叶绿体基因组密码子使用特征分析 期刊论文
海洋科学进展, 2012, 期号: 4, 页码: 587-594
作者:  刘福利;  王飞久;  邵展茹
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长囊水云  叶绿体基因组  密码子使用偏性  最优密码子  
星虫动物线粒体基因组全序列的基因排列和特征比较 期刊论文
水产科学, 2012, 期号: 9, 页码: 554-559
作者:  申欣
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星虫动物  线粒体基因组  基因排列  分子标记