一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法

IOCAS-IR > 实验海洋生物学重点实验室

	一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
	卢霞; 王鸿霞; 刘保忠
	2012-10-10
专利权人	中国科学院海洋研究所.
公开日期	2012-10-10
专利类型	发明
摘要	本发明涉及遗传育种的分子辅助技术，具体的说是一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法。具体为包括微卫星位点来源、引物设计、引物优化和微卫星标记家系鉴定体系确立四个步骤，先用磁珠富集文库方法筛选微卫星序列，用微卫星检索软件进行微卫星片段的快速分离；在微卫星重复的侧翼序列设计引物，优化引物成为微卫星标记；然后对微卫星标记在扩增过程中的重复性、稳定性和多态性信息含量值进行综合评价，确认其中的微卫星标记作为文蛤家系微卫星鉴别体系，用于文蛤不同家系的区分或个体间识别和鉴定，为文蛤遗传选育提供分子标记手段。
关键词	一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法 gc含量为40％?60％包括微卫星位点来源、引物设计、引物优化和微卫星标记家系鉴定体系 2)引物设计：在微卫星重复的侧翼序列利用软件primer?premier?5.0设计引物退火温度为45?65℃ 其特征在于：1)微卫星位点的来源：提取文蛤的基因组dna利用提取的dna 引物设计条件为：引物长度为19?25mer 预期pcr产物长度为100?400bp 采用限制性内切酶法获得文蛤基因组dna片段并构建微卫星磁珠富集文库检测阳性克隆 3)引物优化：根据不同引物的tm值进行温度梯度优化经测序得到含有微卫星重复的dna序列在tm值上下各10℃ 4)微卫星标记家系鉴定体系的确立：微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(Pic)衡量温度梯度优化扩增得到的pcr产物用8％非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳?eb染色系统进行检测根据上述优化获得的ta值选取杂带较少、特异性产物亮度较高的pcr反应对应的温度为该引物的最佳退火温度ta 选取多个体作为群体进行计算微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(Pic)进而衡量多态性信息根据pic值 Pic小于0.25的标记筛选得到重复性好、稳定性好 Pic值大于0.25的位点作为文蛤微卫星标记家系鉴定体系用于文蛤的家系区分与个体识别。
申请日期	2012-04-17
专利号	CN201210112325.X
语种	中文
专利状态	公开
申请号	CN201210112325.X
文献类型	专利
条目标识符	http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/17266
专题	实验海洋生物学重点实验室
推荐引用方式 GB/T 7714	卢霞,王鸿霞,刘保忠. 一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法. CN201210112325.X[P]. 2012-10-10.

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