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作者:刘保忠
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文蛤微卫星标记的检测方法
专利
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112746.2, 申请日期: 2013-01-02, 公开日期: 2013-01-02
发明人:
刘保忠
;
卢霞
;
王鸿霞
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提交时间:2014/08/04
文蛤微卫星标记的检测方法
其特征在于:首先利用文蛤est序列获取微卫星标记的微卫星核心序列
所述特异性引物为正链:5’?tcccaggaacgattgttagg?3’
并在其序列两端设计特异性引物并进行pcr扩增
负链:5’?agcattcacgacaccaacat?3’。
对pcr产物进行非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测
从而检测文蛤个体的基因型
及在此微卫星位点的遗传变异
获得文蛤该位点的遗传多态性图谱
Transcriptional response of lysozyme, metallothionein, and superoxide dismutase to combined exposure to heavy metals and bacteria in Mactra veneriformis
期刊论文
COMPARATIVE BIOCHEMISTRY AND PHYSIOLOGY C-TOXICOLOGY & PHARMACOLOGY, 2013, 卷号: 157, 期号: 1, 页码: 54-62
作者:
Fang, Yan
;
Yang, Hongsheng
;
Liu, Baozhong
;
Zhang, Libing
;
Yang, HS
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提交时间:2014/07/17
Clam
Mollusk
Lysozyme
Metallothionein
Superoxide Dismutase
Heavy Metals
Bacteria
Mactra Veneriformis
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
专利
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112325.X, 申请日期: 2012-10-10, 公开日期: 2012-10-10
发明人:
卢霞
;
王鸿霞
;
刘保忠
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浏览/下载:238/0
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提交时间:2014/08/04
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法
gc含量为40%?60%
包括微卫星位点来源、引物设计、引物优化和微卫星标记家系鉴定体系
2)引物设计:在微卫星重复的侧翼序列利用软件primer?premier?5.0设计引物
退火温度为45?65℃
其特征在于:1)微卫星位点的来源:提取文蛤的基因组dna利用提取的dna
引物设计条件为:引物长度为19?25mer
预期pcr产物长度为100?400bp
采用限制性内切酶法获得文蛤基因组dna片段
并构建微卫星磁珠富集文库
检测阳性克隆
3)引物优化:根据不同引物的tm值进行温度梯度优化
经测序得到含有微卫星重复的dna序列
在tm值上下各10℃
4)微卫星标记家系鉴定体系的确立:微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(Pic)衡量
温度梯度优化扩增得到的pcr产物用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳?eb染色系统进行检测
根据上述优化获得的ta值
选取杂带较少、特异性产物亮度较高的pcr反应对应的温度为该引物的最佳退火温度ta
选取多个体作为群体进行计算微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(Pic)进而衡量多态性信息
根据pic值
Pic小于0.25的标记
筛选得到重复性好、稳定性好
Pic值大于0.25的位点
作为文蛤微卫星标记家系鉴定体系
用于文蛤的家系区分与个体识别。
Tissue-specific response of metallothionein and superoxide dismutase in the clam Mactra veneriformis under sublethal mercury exposure
期刊论文
ECOTOXICOLOGY, 2012, 卷号: 21, 期号: 6, 页码: 1593-1602
作者:
Fang, Yan
;
Yang, Hongsheng
;
Liu, Baozhong
;
Yang, HS (reprint author), Chinese Acad Sci, Key Lab Marine Ecol & Environm Sci, Inst Oceanol, Nanhai Rd 7, Qingdao 266071, Shandong, Peoples R China.
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提交时间:2013/09/24
Metallothionein
Superoxide Dismutase
Mercury
Mrna Expression
Mactra Veneriformis
Toxic effects of benzo[a]pyrene (Bap) and Aroclor1254 on embryogenesis, larval growth, survival and metamorphosis of the bivalve Meretrix meretrix
期刊论文
ECOTOXICOLOGY, 2012, 卷号: 21, 期号: 6, 页码: 1617-1624
作者:
Wang, Qing
;
Yang, Hongsheng
;
Liu, Baozhong
;
Wang, Xiaoyu
;
Yang, HS (reprint author), Chinese Acad Sci, Inst Oceanol, Qingdao 266071, Peoples R China.
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提交时间:2013/09/24
Benzo[a] Pyrene
Aroclor1254
Embryogenesis
Larvae
Metamorphosis
Meretrix Meretrix
一种工厂化循环水养殖系统的排水排污装置
专利
专利类型: 发明, 专利号: ZL200910016966.3, 申请日期: 2011-06-08, 公开日期: 2011-07-15
发明人:
刘鹰
;
程波
;
杨红生
;
宋奔奔
;
王朝夕
;
李贤
;
张涛
;
刘保忠
;
周毅
;
张福绥
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提交时间:2011/07/15
一种适用于浅海底播增养殖的多层组合式海珍礁
专利
专利类型: 发明, 专利号: ZL200910017421.4, 申请日期: 2011-06-08, 公开日期: 2011-07-15
发明人:
许强
;
杨红生
;
刘保忠
;
张立斌
;
刘鹰
;
于宗赫
;
邢坤
;
刘青远
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提交时间:2011/07/15
Large scale gene expression profiling during intestine and body wall regeneration in the sea cucumber Apostichopus japonicus
期刊论文
COMPARATIVE BIOCHEMISTRY AND PHYSIOLOGY D-GENOMICS & PROTEOMICS, 2011, 卷号: 6, 期号: 2, 页码: 195-205
作者:
Sun, Lina
;
Chen, Muyan
;
Yang, Hongsheng
;
Wang, Tianming
;
Liu, Baozhong
;
Shu, Cynthia
;
Gardiner, David M.
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提交时间:2012/07/03
Apostichopus Japonicus
454 Cdna Sequencing
Gene Expression Profiling
Intestine And Body Wall Regeneration
Real-time Pcr
一种以牡蛎壳为材料的刺参增养殖海珍礁及其增养殖方法
专利
专利类型: 发明, 专利号: ZL200910017420.X, 申请日期: 2011-05-11, 公开日期: 2011-07-15
发明人:
杨红生
;
张立斌
;
张涛
;
刘鹰
;
江崇涛
;
许强
;
刘保忠
;
周毅
;
王天明
;
曲光伟
;
李俊辉
;
沈志勇
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提交时间:2011/07/15
一种防止栉江珧幼虫上浮粘连的方法
专利
专利类型: 发明, 专利号: ZL200910231458.7, 申请日期: 2011-02-02, 公开日期: 2011-07-15
发明人:
张涛
;
杨红生
;
邱天龙
;
吴厚刚
;
王诗欢
;
张立斌
;
刘保忠
;
刘鹰
;
周毅
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提交时间:2011/07/15