实验海洋生物学重点实验室知识库

第一章 引言.............................................................................................1
1.1 蛤类生物学特征...............................................................................................1
1.2 蛤类养殖现状...................................................................................................2
1.3 蛤类的生殖周期...............................................................................................3
1.4 蛤类等双壳贝类病害研究进展.......................................................................5
1.5 贝类微生物多样性的研究进展及方法...........................................................7
1.6 研究目的及意义...............................................................................................8
第二章 不同时期文蛤体内细菌类型分析.......................................... 10
2.1 研究背景.........................................................................................................10
2.2 材料方法.........................................................................................................11
2.2.1 幼体培育和样品收集.............................................................................. 11
2.2.2 细菌基因组 DNA 提取和 16S rDNA 扩增............................................ 11
2.2.3 克隆文库的构建...................................................................................... 12
2.2.4 DNA 序列分析.........................................................................................12
2.2.5 数据分析.................................................................................................. 12
2.3 结果.................................................................................................................13
2.3.1 16S rDNA 克隆文库的构建.................................................................... 13
2.3.2 不同时期文蛤样品的细菌多样性分析.................................................. 14
2.3.3 门分类水平不同时期文蛤样品细菌类型分析...................................... 14
2.3.4 纲分类水平不同时期文蛤样品细菌类型分析...................................... 16
2.3.5 属分类水平不同时期文蛤样品细菌类型分析...................................... 17
2.4 讨论.................................................................................................................18
第三章 文蛤壳顶幼虫病原菌的分离鉴定和侵染过程分析..............21
3.1 研究背景.........................................................................................................21
3.2 材料方法.........................................................................................................22
3.2.1 实验动物.................................................................................................. 22
3.2.2 壳顶幼虫细菌的分离培养及鉴定.......................................................... 22
3.2.3 人工侵染实验及形态观察...................................................................... 22
3.2.4 药敏试验.................................................................................................. 23
3.2.5 益生菌对地中海弧菌侵染的影响.......................................................... 24
3.3 结果.................................................................................................................24
3.3.1 地中海弧菌的分离和初步鉴定.............................................................. 24
3.3.2 地中海弧菌对文蛤浮游幼虫致病力分析.............................................. 25

3.3.3 地中海弧菌侵染文蛤幼虫过程显微观察.............................................. 26
3.3.4 地中海弧菌药敏特征.............................................................................. 27
3.3.5 益生菌对地中海弧菌感染的影响.......................................................... 30
3.4 讨论.................................................................................................................31
第四章 菲律宾蛤仔不同发育时期细菌类型分析.............................. 34
4.1 研究背景.........................................................................................................34
4.2 材料方法.........................................................................................................34
4.2.1 样品收集.................................................................................................. 35
4.2.2 DNA 提取和 PCR 扩增........................................................................... 34
4.2.3 文库构建和上机测序分析...................................................................... 34
4.2.4 信息分析.................................................................................................. 34
4.3 结果.................................................................................................................35
4.3.1 测序样品 ASV 和复杂度分析................................................................ 35
4.3.2 菲律宾蛤仔幼虫核心微生物群鉴定分析.............................................. 36
4.3.3 微生物群落结构分析.............................................................................. 39
4.3.4 微生物群落多样性分析.......................................................................... 40
4.3.5 不同健康状态菲律宾蛤仔样品中的指示类群...................................... 47
4.4 讨论.................................................................................................................48
第五章 菲律宾蛤仔幼虫病原菌的分离与鉴定.................................. 52
5.1 研究背景.........................................................................................................52
5.2 材料方法.........................................................................................................53
5.2.1 实验动物.................................................................................................. 53
5.2.2 灿烂弧菌分离与培养.............................................................................. 53
5.2.3 人工侵染实验.......................................................................................... 53
5.2.4 益生菌对灿烂弧菌毒力的影响.............................................................. 54
5.2.5 胞外产物攻毒实验（ECP）................................................................... 54
5.3 结果.................................................................................................................54
5.3.1 灿烂弧菌的分离纯化.............................................................................. 54
5.3.2 灿烂弧菌对菲律宾蛤仔幼虫致病力分析.............................................. 55
5.3.3 胞外产物攻毒实验及毒力相关活性物质检测...................................... 56
5.3.4 益生菌对灿烂弧菌感染的影响.............................................................. 58
5.4 讨论.................................................................................................................59
结论........................................................................................................... 61
参考文献...................................................................................................63

致谢............................................................................................................74
作者简历及攻读学位期间发表的学术论文与研究成果...................... 75