长心卡帕藻(Kappaphycus alvarezii)表达序列标记分析

IOCAS-IR > 海洋生物技术研发中心

	长心卡帕藻(Kappaphycus alvarezii)表达序列标记分析
	刘晨临; 黄晓航; 刘建国
	2011
发表期刊	海洋与湖沼
期号	6 页码:804-810
摘要	分别采用BlastX和Blast2go软件对453条非冗余的长心卡帕藻EST序列进行匹配分析和GO注释。结果表明,有281条序列与蛋白数据库中序列匹配,有132条序列被归属为3个子本体:分子功能、生物学过程和细胞组成。同时筛选到24个与逆境适应相关的基因,包括应对胁迫反应和抗氧化反应的基因。采用GCUA软件,进行长心卡帕藻基因密码子偏倚性的研究。结果表明其密码子偏倚性与其它红藻差别较大,平均G+C含量和密码子的第三位的G+C含量均较其它藻类偏低。上述工作为进一步研究长心卡帕藻基因及其功能奠定了基础。
关键词	长心卡帕藻表达序列标记分析抗逆基因密码子使用频率
语种	中文
文献类型	期刊论文
条目标识符	http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/13074
专题	海洋生物技术研发中心
推荐引用方式 GB/T 7714	刘晨临,黄晓航,刘建国. 长心卡帕藻(Kappaphycus alvarezii)表达序列标记分析[J]. 海洋与湖沼,2011(6):804-810.
APA	刘晨临,黄晓航,&刘建国.(2011).长心卡帕藻(Kappaphycus alvarezii)表达序列标记分析.海洋与湖沼(6),804-810.
MLA	刘晨临,et al."长心卡帕藻(Kappaphycus alvarezii)表达序列标记分析".海洋与湖沼 .6(2011):804-810.