长牡蛎(Crassostrea gigas)EST串联重复序列的组成和分布

IOCAS-IR > 海洋生物技术研发中心

	长牡蛎(Crassostrea gigas)EST串联重复序列的组成和分布
	张琳琳; 李莉; 张国范
	2011
发表期刊	海洋科学
期号	4 页码:41531
摘要	长牡蛎(Crassostrea gigas)串联重复序列分析研究较少,为了研究其在基因组转录本的基本结构特征并为长牡蛎中遗传多样性研究中提供有益的信息,利用NCBI公共数据库中的57 139条长牡蛎ESTs序列对串联重复序列结构类型、分布、丰度等进行系统比较分析。分析结果表明:1)长牡蛎EST中共有小卫星串联重复序列8 392个,在大于100 bp重复类型中,162~167bp含量最高;2)长牡蛎EST SSR含量丰富,1 954个位点是EST-SSR标记开发的候选资源;3)EST-SSR重复数目和重复类型在5′UTR,CDS和3′UTR具有显著差异,CDS区承受更大的选择压力。
关键词	长牡蛎(Crassostrea Gigas) Est 串联重复序列 Ssr 选择压力
语种	中文
文献类型	期刊论文
条目标识符	http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/13049
专题	海洋生物技术研发中心
推荐引用方式 GB/T 7714	张琳琳,李莉,张国范. 长牡蛎(Crassostrea gigas)EST串联重复序列的组成和分布[J]. 海洋科学,2011(4):41531.
APA	张琳琳,李莉,&张国范.(2011).长牡蛎(Crassostrea gigas)EST串联重复序列的组成和分布.海洋科学(4),41531.
MLA	张琳琳,et al."长牡蛎(Crassostrea gigas)EST串联重复序列的组成和分布".海洋科学 .4(2011):41531.